在非自来水的系统原水中一般不含余氯等杀菌剂，反渗透纯水处理设备生产厂家为防止预处理及膜处理系统的微生物污染、预处理系统中应具有杀菌工艺，且杀菌的重点对象是砂滤工艺。当系统中存在炭滤工艺时，二氧化氯、次氯酸钠等氧化性杀菌剂应投放在砂滤之前，这既可阻止砂滤工艺中的微生物滋生，又可与活性炭构成典型的所谓生物活性炭工艺。
      当系统中不存在炭滤工艺，反渗透纯水处理设备生产厂家而投放氧化性杀菌剂时，需要投放亚硫酸氢钠还原剂使之还原、以防对反渗透膜系统的氧化损伤。为保护预处理全系统，氧化性杀菌剂应投放于砂滤工艺之前，还原剂应投放于精滤工艺之后。当超滤工艺置于此杀菌环内时，也可有效防止超滤膜的微生物污染。
      当投放的杀菌剂不具有氧化性时，无需投放还原剂，而且非氧化性杀菌剂进入反渗透膜系统后，还可有效抑制膜系统的微生物污染。反渗透纯水处理设备生产厂家预处理系统环境复杂、工艺多样，各工艺间的相对位置与具体的原水条件及膜系统要求密切相关，各工艺次序的设计具有一定的灵活性。
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